Analyse d’images avec Atlas

L’outil Atlas permet d’appliquer le modèle d’un organe sur une lame virtuelle afin d’identifier avec précision les régions anatomiques de cet organe. Cet outil est particulièrement utilisé pour la segmentation de structures complexes, notamment en neurosciences.

Le protocole :

Les étapes de l’analyse d’images avec l’algorithme Atlas sont les suivantes  :

  • Création de planches anatomiques vectorielles à partir d’images d’Atlas.
  • Travail de l’image dans CaloPix
    Après importation du fichier vectorisé dans CaloPix, différentes fonctionnalités sont mises à disposition de l’utilisateur pour lui permettre de faire correspondre les structures anatomiques de l’Atlas à l’image sous-jacente : translation, redimensionnement, rotation et déformation locale.

Les régions d’analyse (ROA) sont créées automatiquement à partir des structures anatomiques identifiées sur la lames. Ces dernières sont constituées grâce à la superposition de l’Atlas. L’utilisateur peut soit créer une région d’analyse pour chaque structure sélectionnée ou bien une région d’analyse regroupant plusieurs structures.