Analyse d’images avec Morphometry Fluo

L’algorithme Morphometry Fluo permet de quantifier des cellules à partir de seuils en luminance et d’opérateurs morpho-mathématiques. Cet algorithme est fréquemment utilisé pour des quantifications en IF et notamment l’étude de la colocalisation de marquages fluorescents.

Le protocole :

Les étapes de l’analyse d’images avec l’algorithme Morphometry Fluo sont les suivantes  :

  • Segmentation de l’image
    Une segmentation en luminance est réalisée sur chacun des fluorochromes.
  • Application d’opérateurs morpho-mathématiques
    L’analyse est affinée par l’application de critères morpho-mathématiques tel que le lissage, l’érosion et la dilatation, la ligne de partage des eaux, la taille…
  • Analyse du co-marquage
    Cette analyse est effectuée par intersection des masques.

Les résultats présentent le nombre d’objets segmentés, la part de la surface occupée par les objets et intègrent une description de chaque objet.

Il est également possible de construire un modèle d’apprentissage basé sur l’outil RFT. On utilisera ensuite l’algorithme d’analyse d’images IOBL pour la quantification de lames multiplexées en fluorescence.